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同源序列 引物设计

一般对于已知序列的PCR当然不要从保守序列来设计引物,只要从开放可读框前后开始设计就行了.需要从保守序列设计引物的情况一般是两种,一是某个物种里面某个特定基因序列从未被分离过,但其进化关系相近的物种有分离出这个基因的同源基因,这样我们...

引物设计有 3 条基本原则: 引物与模板的序列要紧密互补。 引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构。 再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。 引物设计引物是人工合成的两段寡核苷酸序列,一个引物与目的基因一端的一...

般于已知序列PCR要保守序列设计引物,要放读框前始设计行.需要保守序列设计引物情况般两种,某物种面某特定基序列未离,其进化关系相近物种离基同源基,我调取些同源基,比查看保守序列设计引物,利用引物获物种基部序列.再设计RACE获全序列.另外种情...

研究物种中目的基因序列已知的话就不需要同源性比较 直接设计特异性引物 如果序列未知 则根据近似物种序列比较序列保守区 设计简并引物 若近似物种也没有相关基因信息 基因序列又高度保守 也可以是人 鼠 原鸡等的比较

不知道序列,知道是什么基因的话,可以根据物种之间的同源性在保守区域设计引物,然后再用race等技术扩全长,如果基因名字什么都不知道的话。。。那就图位克拢。

选择保守区序列是指不同来源(物种、群、菌株)核苷酸或蛋白质序列高度同源的那个区域。 选择核苷酸序列的保守区设计引物,其一是为了防止PCR扩增时由于序列变异而导致的PCR假阴性;其二,用一对引物就可以应用于不同菌(毒)株(物种、区域)来...

用RACE扩增要还一些,用保守序列扩增一个问题是保守区位置不好,扩增后任然不是基因全长,第二个你是新手保守序列设计引物不一定能设计到合适的引物。

是编码链。用错链对引物设计有影响,因为核苷酸结构不对称,分三端和五端。 所以5'-ATCGXXXXXXXXXXXXXX 和 3‘-ATCGXXXXXXXXXXXXXX是两个不同的引物分子。 引物设计软件都使用编码链,所以楼主不用烦了直接复制粘贴好了哇。

引物设计原则: 1、长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。 2、G十c含量:应在45%一55%之间,PCR扩增中的复性温度一般是较低Tm值引物的Tm...

一般使用primer5就挺好,不知道你是扩基因还是启动子,基因是否是已知。 PCR引物设计原理: PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段,使其能有效地扩增模板DNA序列。因此,引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。 要设计引物首先...

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